전자정부가 효율적으로 운영되려면 정부 부처마다 제각각인 전산환경부터 통합돼야한다. 국민의 정보화 수요가 급증하는 상황에서 단순히 전산인력을 늘리는 것만으로는 따라잡는데 한계가 있기 때문이다. 양적인 팽창보다는 질적인 "업그레이드"이 먼저라는 얘기다. 정부 부처끼리 정보를 주고받는 일이 많아지고 있다는 점을 고려하더라도 미룰 수 없는 일이다. 실제로 공공부문의 전산운영 비용은 지난 97년 3천7백억원에서 98년 6천4백억원,99년 6천7백억원으로 증가하고 있다. 반면 정부 기관간에 정보를 효율적으로 교류하는 것은 별다른 진척이 없다. 정부기관의 35%가 기술적 제약으로 인해 다른 기관의 시스템에 저장한 정보를 이용하지 못한다고 하소연하고 있다. 행정자치부와 기획예산처,정보통신부는 이같은 단점을 보완하기 위해 정부통합전산센터를 구축하기로 첫단계로 SI(시스템통합) 사업자를 선정하기로 했다. 그러나 지난 4월 실시한 사업자 선정을 위한 입찰이 완전 유찰됐다. 국내 SI업계 1위인 삼성SDS와 LG CNS가 컨소시엄을 구성해 입찰에 참여했지만 기술력이 미흡하다는 평가를 받아 탈락한 것.이로 인해 일각에선 통합전산환경 구축 계획이 "백지화"될 위기에 놓였다는 지적도 나오고 있다. 행자부 등은 금명간 이 사업을 재추진할 방침이다.