공무원노조 입법화를 추진해온 양대 단체인 전공노와 공노련은 노선이 다소 다르다. 이정천 공노련 위원장은 "노동운동이 물리적 행동만은 아니다"며 "법 속에서 근무하는 공무원이 비폭력에 앞장서자는 취지에서 노동부 입법안을 현실적 대안으로 선택하되 조기입법에 노력하겠다"고 말했다. 이는 "노동부 입법안은 (우리가 주장하는 것과) 지나치게 차이가 커 노동3권 완전 확보를 위해 투쟁하겠다"며 파업 찬반투표를 진행중인 전공노와는 대조적이다. 이같은 전공노와 공노련간 시각차의 속내는 누가 교섭의 주도권을 잡느냐는 데 있다는 분석이다. 전공노는 지난 21일 파업찬반투표 강행을 밝히면서 △노동3권 보장 △특별법 제정이 아닌 노동관계법 개정 △전공노를 유일 교섭단체로 인정 등을 주장했다. 이 가운데 교섭창구 관련 부분이 첨예한 시각차를 가져온 것으로 보인다. 공노련측이 이날 "전공노가 (정부에) 유일 교섭단체 인정을 압박하고 있다"며 불편한 심기를 드러내면서 "정치권과 논의를 거쳐 의원 입법발의한 법안을 조속히 통과시켜야 한다"고 주장한 것은 이런 맥락에서 비롯됐다는 지적이다. 정부 관계자는 사견임을 전제,"전국의 6급이하 공무원 43만여명이 가입대상인 거대조직의 탄생을 앞둔 상황에서 누가 조직의 주도권을 잡느냐는 매우 중요한 사안"이라고 말했다.