UNIST, TonEBP 단백질의 R-루프 제거 과정 밝혀
세포 삼투압 조절 단백질의 암·노화 억제 관여 규명
세포 삼투압을 조절하는 단백질이 암이나 노화를 억제하는 데도 관여한다는 사실을 울산과학기술원(UNIST) 연구팀이 밝혀냈다.

UNIST에 따르면 권혁무, 이자일, 명경재 교수 연구팀은 'TonEBP'(톤이비피) 단백질이 DNA의 이상 구조인 'R-루프'(R-loop)를 제거하는 데 관여한다는 사실을 규명했다.

R-루프는 전사(transcription·DNA를 주형틀로 하는 RNA가 합성되는 것) 과정에서 DNA 이중나선 구조가 일시적으로 벌어지면서 생기는 고리 모양 구조체다.

R-루프가 제때 없어지지 않고 축적되면 DNA 복제에 이상이 생기고 암이나 노화 현상이 촉진되는 것으로 알려져 있다.

연구팀은 세포를 관찰하던 중 R-루프가 생성된 곳에 TonEBP 단백질이 공존한다는 것을 발견하고, 이 둘 간의 상관관계를 살피기 시작했다.

연구 결과 TonEBP 단백질은 R-루프를 인지한 후 RNA 제거 효소를 R-루프 쪽으로 끌어오는 과정을 활성화하는 것으로 나타났다.

R-루프는 벌어진 한 쌍의 DNA 가닥 중 한 가닥 위에 전사를 통해 합성된 RNA가 붙여진 구조인데, 이 RNA 가닥이 제거되면 DNA 가닥이 평상시 안정한 이중나선 구조(실 두 개가 꼬여 있는 형태)로 봉합된다.

연구팀은 TonEBP 단백질이 RNA 제거를 촉진하는 구체적인 과정을 규명했다.

TonEBP 단백질이 DNA에 형성된 R-루프를 인식해 찾은 후 RNA의 메틸화를 돕는 효소인 METTL3(엠이티티엘쓰리)와 결합해 메틸화 반응을 촉진한다.

메틸화 반응은 RNA의 특정 부위에 메틸 작용기가 붙은 과정인데, 이 반응은 RNA 제거 효소를 R-루프로 유인하게 된다.

세포 삼투압 조절 단백질의 암·노화 억제 관여 규명
연구팀은 TonEBP 단백질이 R-루프를 찾아가는 방식도 밝혀냈다.

TonEBP 단백질은 R-루프에 바로 결합하거나 DNA 가닥 위를 타고 이동하다가 R-루프를 인식하는 두 가지 방식 모두를 이용해 30억 개 염기쌍으로 구성된 사람의 DNA에서 R-루프를 빠르게 발견한다.

연구팀은 DNA 위를 이동하는 단백질의 움직임을 실시간으로 볼 수 있는 특수 기법인 'DNA 커튼' 기법을 사용했다.

연구는 국제 학술지인 '뉴클레인 에시즈 리서치'(Nucleic Acids Research)에 11일 자로 온라인 게재됐다.

연구 수행은 한국연구재단, 기초과학연구원(IBS), 삼성미래기술육성사업의 지원을 받아 이뤄졌다.

/연합뉴스